Forsker fra RUC får 11 mio. kr. til at udvikle et værktøj til at opspore farlige bakterier

Et lille håndholdt apparat og en analyseplatform kan i kombination blive et værktøj, som kan styrke behandlingen af alvorlige infektioner på sygehusene i fremtiden.

Med apparatet i hånden vil lægen potentielt kunne teste en enkelt dråbe blod, spyt eller urin fra patienten for bakterier. Nanosensorer i apparatet registrerer stoffer, som bakterierne udskiller, og resultaterne overføres automatisk til analyseplatformen. Målet er, at lægen hurtigt skal kunne få information om, hvilke bakterier der er til stede, og samtidig få indblik i infektionens udvikling og bakteriernes egenskaber.

Sådan nogenlunde forestiller lektor Fatima AlZahra'a Alatraktchi sig fremtiden med det værktøj, hun nu med sit LF Fellowship kan gå i gang med at udvikle i projektet DECODE på Institut for Naturvidenskab og Miljø på Roskilde Universitet.

Tværfaglig forsker og forfatter besat af bakterier

Fatima AlZahra'a Alatraktchi er både nanofysiker og mikrobiolog og arbejder i krydsfeltet mellem de to discipliner. Hun er også forfatter og har netop udgivet en bog med titlen ’Besat af bakterier’. Og det er hun.

”Jeg har været optaget af bakteriernes ’sprog’, siden jeg under min bachelor blev klar over, at bakterier kommunikerer. Så det her er et drømmeprojekt for mig,” siger hun.

”Bakterier taler sammen ved at udskille molekyler, mens de inficerer os. Kan vi ’oversætte’, hvad de siger, kan vi måske finde ud af, hvor farlige de egentlig er.”

I projektet skal forskerne arbejde med molekyler, som er biomarkører for tre bakterier fra WHO’s liste over højrisiko-bakterier. WHO peger på antibiotikaresistens som en af de største globale sundhedsudfordringer, og organisationen efterspørger nye løsninger, der kan gøre diagnostik hurtigere og mere præcis.

Bakterierne er velkendte på sygehusene hos patienter med henholdsvis blodforgiftning, alvorlige urinvejsinfektioner og hos patienter i respirator.

For hver af bakterierne skal sensorer reagere på såkaldte virulensfaktorer (VRs). Det er molekyler, bakterierne udskiller tidligt i infektionen, og som gør dem farlige. VRs kan for eksempel få bakterierne til at skade vævet eller undvige immunforsvaret.

Udvikle og optimere sensorteknologier 

Fatima AlZahra'a Alatraktchi har tidligere udviklet nanosensorer. I projektet skal hendes forskergruppe udvikle og optimere sensorteknologier specifikt til de tre bakterier. Og de skal karakterisere bakterierne og deres VRs under forskellige forhold og udsætte dem for antibiotika og for immunforsvarets molekyler.

”Det centrale er at opnå en dyb forståelse af biomarkørernes betydning i relation til sygdomstilstande, forløbet af en infektion og udvikling af resistens. Og selvfølgelig at teste det hele i klinisk sammenhæng,” siger Fatima AlZahra'a Alatraktchi.

Målet er at give lægerne et værktøj til hurtig, præcis og individualiseret behandling af patienter med infektioner. I dag kan det tage dage at få prøvesvar fra laboratoriet, og lægen forsøger sig måske i mellemtiden med et middel, der ikke virker. Det vil Fatima AlZahra'a ændre med DECODE: 

”Hvis vi lykkes med et værktøj til de her tre bakterier, kan vi skalere til andre sygdomsfremkaldende bakterier og udvide patientgruppen. Så har vi en regulær omvæltning af, hvordan vi diagnosticerer. Det kan potentielt både begrænse forbruget af antibiotika og redde liv,” siger hun.

Fakta om bevillingen og Fatima AlZahra'a Alatraktchi:

• Uddannelse: Cand.polyt.-uddannelse i nanofysik, DTU, ph.d. i nanoteknologi og molekylær biologi, DTU
• Lektor i translationel biomedicin ved Institut for Naturvidenskab og Miljø på Roskilde Universitet
• Forfatter til bl.a. bogen 'Besat af bakterier' (2026) og står bag TEDx Talk ’To detect diseases earlier, let's speak bacteria's secret language’ , der har været set over 2 mio. gange og er tekstet på 19 forskellige sprog 
•  Projekttitel: Afkodning af bakteriel virulens: Diagnostik og prognose af infektionsforløb (DECODE)
• Bevilling: 11 mio. kr. fra Lundbeckfonden